净心庵始建于清光绪年间(1875-1908)，是上海市所有佛教寺庙中离普陀山最近的尼庵，其缘起也与普陀山有着法脉相传的故事。净船老师太(1858—1932)是净心庵的创始人，她在普陀山出家并受具足戒，为弘扬佛法，普度众生，离开普陀名山告别德高望重的师傅清□法师，独自一人来到与普陀山一海之隔的南汇泥城地区，净船师太先建造起观音殿等三间草屋。清光绪六年(1880)净心庵建大雄宝殿，后逐渐扩大到五十六间庙房，占地十余亩，成为当时南汇县最大的比丘尼庵。二十世纪初期，净心庵进入鼎盛时期，全庵比丘尼多达七、八十位。
净心庵的师徒法系是按照清法师的一首诗排列的：“清净莲华从心载，全凭功行方德开；若能一身常精进，定超上品见如来。”百多年后的今天，此法系仅传到“心”字辈，估计二十八字全传完已超过佛历三千年。净心庵的根在普陀山，净心庵是普陀山散落在上海浦东地区的一个枝杈，追溯往昔，净心庵各位师太的祖师法脉应传自普陀山观音菩萨信仰。
净心庵属净土宗，以念佛、诵经、早晚功课为主。民国二十一年(1932)，净船老师太圆寂后，由其徒弟莲胜师太任住持。民国二十九年(1940)以后由华圆师太任第三任住持。解放前夕，因华圆师太出身成份关系，其独自离庵。从此，庵内群龙无首，暂缺住持，比丘尼从四十人锐减到十六人。
解放前后，每年农历六月十九日观音成道日为净心庵庙会，除庵内信众烧香还愿外，庵外的集市贸易布满了整个南横港(当初分南、中、北三个横港)，农民在此购买吃、用、农具等物品。净心庵庙会最长时连续达三天之久，吸引了方圆数十里的香客和游人。
1945年夏季，净心庵尼众在焚烧净船、莲胜、莲松三位老师太的遗骨时，化出四颗手指状大小的舍利子，三颗透明如水晶，一颗略带银灰色，由于当初混烧在一起，分不清这四颗舍利分属何人，但至少可以肯定，功德无量的净船老师太必有舍利无疑。凡有舍利者，必往生西方净土，这正应了老师太的师傅所写法脉诗句中“定超上品见如来”之语。
文革前，净心庵让出一半庙房成立了“横港农业中学”，后改为“泥城横港中学”，为培养建国初的一大批工农业有用人才作出了贡献，体现了佛弟子爱国重教的高尚品质。文革中，净心庵受到了极大冲击，1966年农历八月廿四日，佛像被焚烧毁坏，出身不好的比丘尼被赶出庵堂，净心庵供奉的无价之宝——舍利子佛塔也被推倒在河中，舍利子从此不知去向。此后，寺庵被工厂所用，宗教活动被迫全面停止。
从彬师太(出生于1918年)是重建净心庵的带头人，她于1937年出家到净心庵，在南京市宝花山龙昌寺受具足戒，后仍回净心庵修持，1957年至1961年在周浦巽龙庵，1961年后均在净心庵。文革后，从彬师太坚持与其他五位比丘尼住在净心庵仅存的六间庙房内，过着自食其力的艰苦生活，但从彬师太时刻期盼着净心庵能够复兴的一天。
十一届三中全会以后，宗教政策得到了落实，上海居士王鉴君、金英夫妇俩将在文革中冒着生命危险密藏于家中的西方三圣塑像及其他塑像先后赠送到净心庵原址。从此，净心庵重又开始供起佛菩萨。为了弘扬佛法，从彬师太主动担负起重建净心庵的重任，成为净心庵当之无愧的第四任住持。八十年代，经其多方奔走，联系了村、乡、县各级有关政府部门，终于于1990年经南汇县人民政府批准，在县宗教办帮助下将净心庵恢复为佛教活动场所。在从彬师太的领导下，经多年募捐筹集资金，1992年农历六月十九日净心庵东迁至现址，并重建大雄宝殿及东厢房，当时的建造费用为三十余万元人民币，其中两成由信徒捐献。
现址的净心庵占地三亩二分六厘，建筑面积686平方米。1992年(壬申年)仲秋，时任上海佛教协会主席真禅大和尚手书“净心庵”寺匾，至今该匾仍悬于净心庵山门牌楼之上。1994年净心庵建造起了连在一起的山门间、天王殿。1995年，西厢房及宝鼎落座，从彬师太于是年秋作《重建净心庵》诗一首：“十年浩劫寺庙艾，众生不知莲华台。宿债未酬迷造业，三毒五欲泛成灾。功德无量勇施财，乐助造殿佛门开。信为道源善根深，缘聚净修极乐来。”1996年建祖堂间，1997年在大殿两侧增添了十八尊罗汉，1998年佛菩萨塑像重新装金，全庵上下整修一新。至1998年农历九月初六，由上海市和南汇县佛教协会共同参与，净心庵举行了隆重的佛像开光大典仪式，实现了复兴之愿。
1998年深秋，皈依佛弟子释妙清曾为净心庵写有历史碑记，记载了净心庵一百十八年来的历史沧桑。如今的净心庵仍静静地屹立在泥城横港乡临近洋山高速路的近旁，由于洋山港的飞速建设，净心庵周边已经面目全非，庵前的河流已成断流死水，桥上的石桥默默地承载着历史变迁。由于净心庵为不可移动文物建筑，所以她并未随着周边的拆迁而被损毁，但其庵堂本身与庵后的一片竹林与浦东的高楼叠起的建设相映成趣。
净心庵作为上海离普陀山最近的佛寺，以二十八字诗文排列法脉，又有僧尼的真身舍利子出现的神奇历史，实在是上海地区尼庵教众的一段传奇。如今南汇地区众多尼庵的一干尼众多为从字辈与心字辈，证明净心庵也是南汇地区各尼庵的法脉根源，相信在佛祖与观世音菩萨的护佑下，此枝普陀山的外传法脉定能得以源远流长，万古流芳。
上海浦东净心庵地址
上海市浦东新区泥城镇横港村13组秋祥路
